Nuwe Bioinformatika Vir Linux
STAPPE is 'n pakket vir die presiese stogastiese simulasie van reaksie-diffusie stelsels in arbitrêr komplekse 3D geometrieë. Ons kern simulasie algoritme is 'n implementering van Gillespie se SSA, uitgebrei om te gaan met verspreiding van...
NEO (Neurale Ensemble voorwerpe) en is 'n projek om 'n gemeenskaplike stel basis klasse te voorsien om gebruik te word in neurale data-analise, met die doel om om OpenElectrophy, NeuroTools en miskien ander projekte met soortgelyke doelwitte meer...
OpenElectrophy is 'n raamwerk manipulasie, stoor en ontleding van elektrofisiologiese data te fasiliteer. Dit kan data invoer van baie verskillende lêer formate en stoor dit in 'n enkele SQL-tipe databasis.Analise-instrumente ingesluit in...
turf n suite van programme vir die vaslegging, voorspelling en ontleding van biofisiese eienskappe van proteïene.Sien http://enzyme.ucd.ie/PEAT dokumentasie, instruksies, screenshots, ens Vereistes :. ...
Burrows-Wheeler aligner (BWA) is 'n doeltreffende program wat in lyn relatief kort nukleotiedvolgordes teen 'n lang verwysing volgorde soos die menslike genoom.Die sagteware implemente twee algoritmes, BWA-kort en BWA-SW. Die voormalige werke vir...
SSuMMo is 'n biblioteek van funksies ontwerp om iteratief met behulp hmmer rye te ken aan taxa & nbsp;. Resultate is hoogs geannoteerde bome wat spesies / genus verspreiding binne daardie gemeenskap.Programme ingesluit met die bron-kode sluit...
dikkop is 'n Python API vir die lees van binêre data lêers geskep met behulp van die data bestuur raamwerk dikkop next-gen.Gewoonlik, hierdie gids kom as deel van die volledige dikkop pakket, beskikbaar vanaf:& Nbsp; http: //goby.campagnelab.org/Die...
PySCeS is 'n projek wat deur die Trippel J-groep vir Molekulêre Selfisiologie & nbsp;. Om model te probeer en die komplekse prosesse en stelsels waaruit die lewende sel verstaan Eienskappe :. 'n teks-gebaseerde model beskrywing taal ...
Pysam is 'n Python module vir die lees en te manipuleer Samfiles & nbsp;. Dit is 'n liggewig wrapper van die samtools C-API.Die vinnige begin gids is hier. Meer gedetailleerde dokumentasie is hier beskikbaar.Vrae en kommentaar is baie welkom en...
TRMiner is 'n Python nut wat daarop gemik is wetenskaplike data kurators & nbsp;. Dit laat vinnig snoei groot versamelings van wetenskaplike publikasies sinne wat relevant is vir 'n gegewe mynbou doel.Dit word bereik in twee stappe. Eerstens, is...
