MACS2 is 'n model gebaseerde analise hulpmiddel vir chip-Volg data.
Met die verbetering van volgorde tegnieke, chromatien immunoprecipitatie gevolg deur hoë deurset volgorde (chip-volgende) is steeds gewild genoom-wye proteïen-DNA interaksies te bestudeer. Die gebrek aan 'n kragtige chip-Volg analise metode aan te spreek, bied ons 'n roman algoritme, vernoem Model-gebaseerde Ontleding van chip-Volg (MACS), vir die identifisering van transkripsie faktor binding plekke. MACS vang die invloed van genoom kompleksiteit die betekenis van verryk chip streke te evalueer, en Macs verbeter die ruimtelike resolusie van binding plekke deur die kombinasie van die inligting van beide volgorde tag posisie en oriëntasie. . Mac kan maklik gebruik word vir chip-Volg data alleen, of met beheer monster met die toename van spesifisiteit
Vereistes :
- Python
Kommentaar nie gevind