RAPTOR

RAPTOR is 'n innoverende sagteware ontwerp vir akkurate proteïenstruktuurvoorspelling. Dit kombineer gevorderde analise gereedskap in een geïntegreerde sagteware oplossing en bied drie verskillende metodes threading. RAPTOR se unieke heeltallige programmering optimization benadering is die mees doeltreffende vir die vind van struktuur templates van teikens met 'n lae volgorde homologie en is in staat om 'n hoë gehalte modelle te genereer. Die maklik-om-te gebruik koppelvlak en maklik-om-te verstaan ​​E waardes is ideaal vir beginners en kundiges. Bo alles, die intuïtiewe vertoning van die uitset gebruikers in staat stel om die resultate te verstaan ​​eenvoudig 'n oogopslag. Gegewe 'n teiken proteïen volgorde, as daar 'n homoloë proteïen met 'n bekende 3D struktuur, dit kan gevind word deur die gebruik van volgorde search gereedskap soos PSI-BLAST, ook in RAPTOR. Struktuur van die teiken word dan gebou uit die bekende struktuur; Maar wanneer die volgorde homologie is nie betekenisvol nie, dws minder as 25% is, kan PSI-BLAST nie kom met 'n selfversekerde treffer. Anders PSI-ontploffing, wat eenvoudig nie 'n volgorde soek, proteïen threading, vou erkenning, maak gebruik van beide homologie en struktuur inligting. Dit skanderings die proteïen volgorde met 'n onbekende struktuur teen 'n databasis van bekende strukture. Deur die gebruik van 'n puntestelsel funksie en die uitvoer van versoenbaarheid analise tussen driedimensionele strukture en lineêre proteïen volgordes, sal die beste strukturele sjabloon geïdentifiseer waaruit struktuur die volgorde se bou. As 'n resultaat, proteïen threading gee 'n beter voorspelling as homologie modellering wanneer daar marginale volgorde homologie

Beperkings :.

Limited funksionaliteit