BioRuby

BioRuby bied 'n geïntegreerde omgewing vir Bioinformatika (Biologie Inligtingkunde).
Objekgeoriënteerde script taal Ruby het baie funksies wat geskik is vir bioinformatika navorsing, byvoorbeeld, 'n duidelike sintaksis om komplekse voorwerpe, gereelde uitdrukkings vir die teks hantering so sterk soos Perl & rsquo druk; s, 'n wye verskeidenheid van biblioteke, insluitend web diens ens
As die Ruby sintaksis is eenvoudig en baie skoon, glo ons dat dit maklik is om te leer vir beginners, maklik om te gebruik vir bioloë, en ook sterk genoeg vir die sagteware-ontwikkelaars.
In BioRuby, kan die ontwikkelaar biologiese inskrywings databasis van plat lêers, internet web bedieners en plaaslike relasionele databasisse te haal.
Hierdie databasis inskrywings kan ontleed word om inligting wat jy nodig het te onttrek. Biologiese rye kan behandel word met die vervullende metodes van die Ruby & rsquo; s String klas en met gereelde uitdrukkings.
Die biblioteek kan geïntegreer word met gereedskap soos Blast, FASTA, Hmmer en baie ander sagteware pakkette vir biologiese ontleding.
 BioRuby ondersteun groot biologiese databasis formate en bied baie maniere om toegang tot hulle deur flatfile kruip, SQL, web dienste ens Verskeie web dienste, insluitend KEGG API kan maklik gebruik word deur BioRuby.

Eienskappe :

• BioRuby dop
• API
• Dokumentasie

Vereistes :

• Ruby 1.8.7 of hoër