Serial Cloner

Serial Cloner is 'n molekulêre biologie sagteware. Dit bied gereedskap met 'n intuïtiewe koppelvlak wat help jou in DNA kloning, volgorde analise en visualisering. Serial Cloner is ontwikkel 'n ligte molekulêre biologie sagteware vir beide Macintosh en Windows gebruikers te voorsien. Serial Cloner lees en skryf DNA Strider (tm) compatible lêers en die invoer en uitvoer lêers in die universele FASTA formaat (sowel as in pDRAW32 formaat). Kragtige grafiese vertoon gereedskap en eenvoudige koppelvlak help om die ontleding en konstruksie stappe (adapter, PCR, Gateway [tm] kloning) in 'n baie intuïtiewe manier. Weergawe 1.3 voeg nou 'n virtuele snyer, 'n webblaaier met onmiddellike invoer van Ncbi / EMBL inskrywings en 'n stille beperking kaart saam met ander verbeterings.

Wat is nuut in hierdie release:

• [NEW] Skattings isoelektriese punt van proteïen volgordes (DNA en proteïen Volgorde venster)
• [NEW] MacOSX weergawe nou versprei as 'n getekende aansoek (Mountain Lion Keeper aanpasbaarheid)
• [TOEGEVOEGDE] 'n opsie in die Voorkeure pK waarde tafels te kies om te gebruik vir pI skatting
• [TOEGEVOEGDE] 'n opsie in die voorkeure die kodon kode van kodon Gebruik tabelle te gebruik as 'n genetiese kode wat gebruik word vir vertaling
• [TOEGEVOEGDE] 'n opsie in die restriksiekaart venster net nukleotiede wat in hoofletters
vertaal
• [TOEGEVOEGDE] 'n knoppie / menu spesifieke plekke te kies om in Beperking kaarte vertoon word.
• [TOEGEVOEGDE] Skandeer vir peptied funksies in proteïen volgordes
• [TOEGEVOEGDE] Besit Kenmerke wanneer reverse-vertaling van 'n DNA-volgorde
• [TOEGEVOEGDE] 'n vinnige skakel tussen 'n DNA en proteïen Rig venster
• [TOEGEVOEGDE] Nie geformateer afskrif van proteïen volgorde (Kopieer Meer ... Menu)
• [TOEGEVOEGDE] Besit Kenmerke wanneer kopiëring / plak proteïen volgordes
• [TOEGEVOEGDE] skerm funksies in Protein Rig (Plaaslike Rig)
• [TOEGEVOEGDE] 'n swikknoppie verskille in lyn proteïene te lig
• [TOEGEVOEGDE] 'n kortpad (S) te vinnig wys of masker Kenmerke (in die blad Kenmerke van Volgorde Windows)
• [TOEGEVOEGDE] "anker" en "kern" domeine van Primers word nou erken as Kenmerke in volgorde Windows
• [TOEGEVOEGDE] 'n knoppie om vinnig te kies 'n volle lineêre insetsel in die 'Bou 'n Konstrueer 'n venster
• [TOEGEVOEGDE] het 'n kortpad na 'kopie Nie geformateer' [opdrag-SHIFT-K]
• [TOEGEVOEGDE] 'n menu-item om te gaan na Serial Cloner Forum
• [TOEGEVOEGDE] 'n menu-item om te gaan na Serial Cloner Youtube Channel (tutoriaal)
• [Opgedateer] Dit is nou moontlik om ten volle grootte Volgorde vensters
• [Opgedateer] Afwesig webwerwe in italic in ensiem kieser vensters aangedui (Grafiese en Beperking Maps)
• [Opgedateer] Unieke webwerwe word in vetdruk in ensiem kieser vensters aangedui (Grafiese en Beperking Maps)
• [Opgedateer] Parsing van Ncbi rye (Web Access) te neem in ag veranderinge in Ncbi bladsye.
• [Opgedateer] Verbeterde parsing van rye met 'X' in die nukleotiedvolgorde
• [Opgedateer] Veranderde kortpad van 'kopie Alle sekwense te Multifasta' te [opdrag-SHIFT-J] in plaas van [opdrag-SHIFT-K]
• [GECORRIGEERD] 'n Windows-spesifieke koppelvlak fout die die 'Invoer kodon Bias' venster
• [GECORRIGEERD] 'n fout soms voorkoming behoorlike afskrif van beelde (Grafiese kaart, Virtuele Sny, shRNA) in die knipbord (Windows spesifieke)
• [GECORRIGEERD] 'n probleem ontstaan ​​met ongewoon RE name soos R1.BceSIV in die besonder ensiem "kieser van die Grafiese Map.
• [GECORRIGEERD] 'n probleem [Gateway Kloning] met funksies aanduiding wanneer die bestemming vektor was antisense (att2-att1 rigting)
• [GECORRIGEERD] 'n fout in die keuse van die mees gebruikte AA toe omgekeerde vertaling
• [GECORRIGEERD] 'n probleem met die "Select All" in volgorde en Proteïen vensters
• [GECORRIGEERD] 'n lêer tipe probleem wat verband hou met Serial Cloner lêers (breek verenigbaarheid met Sequencher invoer in die besonder)
• [GECORRIGEERD] Afbinding: Soms onnodig geproduseer ontaard DNA
• [GECORRIGEERD] Gateway: gegenereer DNA maar dan wanneer dan gered as onbekende tipe
• [GECORRIGEERD] PCR. Indien dit op die "onbekende formaat" volgorde, verkeerdelik gegenereer "Protein" tipe
• [GECORRIGEERD] 'n probleem opdatering Feature wanneer die verwydering van 'n wysiging
• [GECORRIGEERD] Wanneer plak 'n proteïen volgorde in GenBank formaat (Ncbi) 'n proteïen volgorde venster is nou reg geskep.
• [GECORRIGEERD] 'n probleem met die Ncbi BLAST bediener wanneer die gebruik van nie-ASCII karakters in volgorde name
• [GECORRIGEERD] 'n probleem met die funksie vertoon nadat 'n skandering wanneer slegs een kenmerk was gevind
• [GECORRIGEERD] 'n seldsame probleem van Feature vertoning in die konstruk Venster
• [GECORRIGEERD] 'n verfris probleem by die gebruik van lettergrootte verskil van 12 pt in Grafiese kaarte.
• [GECORRIGEERD] 'n fout in die Beperking kaart vensters waar die eerste lyn van aminosuur vertaling is verskuif in kodon modus
• [GECORRIGEERD] 'n fout met betrekking voorkoming van die gebruik van voorheen gekies ensieme in die virtuele Cutter Venster