Bibliosphere Analysis Kit

BiblioSphere bied 'n unieke kombinasie van letterkunde-mynbou en pad-analise vir molekulêre bioloë belangstel in geenregulering en biologiese netwerke.
 BiblioSphere Pathway Edition gebruik 'n omvattende databasis van individueel geskoei verhoudings tussen gene, proteïene, komplekse, selle en weefsels saam met die up-to-date inligting ontginning tegnieke vir outomatiese kennis onttrekking te kan jy jou data om te skakel na biologiese netwerke in verskillende biologiese kontekste.
 Gebruik BiblioSphere na

• brei biologiese netwerke buite kanonieke pad inligting (regulatoriese & metaboliese)
• saamsmelt jou hoë deurset resultate met biologiese kennis en volgorde gebaseer ontledings
• voer konteks- sensitiewe regulatoriese pad analise
• genereer eksperiment spesifieke pad variante
• skakel paaie na siekte meganismes & gene
• doen gevorderde eksperimentele ontwerp

Wat is nuut in hierdie release:

Nuwe en verbeterde Databronne

• Genomatix Expert saamgestel Gene-Gene Betrekkinge:
   Genomatix het geïntegreerde sy eie kennis-basis van kundige saamgestel data op geenregulering in BiblioSphere. Hierdie unieke data bron voeg die semantiek van die gene-gene verhoudings met die dinamies gegenereer BiblioSphere gene netwerke, die verskaffing van inligting soos "Gene A aktiveer transkripsie van gene B" of "Gene A wisselwerking fisies met gene B".
  
• seintransduksiepaaie:
   Gedeeltes van Gene Ontologie relevant tot seintransduksie asook data saamgestel uit die literatuur is gekombineer om die identifisering van kanonieke paaie gekoppel aan die netwerk gefokus te maak.
  
• metaboliese baan Verenigings:
   Metaboliese baan verenigings is verweef in die identifisering van metaboliese gebeure relevant is vir jou stel gene te laat.
  

• Pathway View met kundige saamgestel gene-gene verhoudings
   Gene groepe word in maklik verstaanbare dinamiese netwerk grafieke kombinasie hand saamgestel gene-gene verhoudings met data afgelei van outomatiese kennis onttrekking saamgestel. Netwerke kan aangepas word deur filters en gefokus op 'n geen gesentreer manier kortste pad analise uit te voer.
  
• sellulêre ligging View
   Gebaseer op GO Annotations gene aan hul subsellulêre plek opgedra en gevisualiseer as 'n diagrammed sel uitleg, sodat jy subsellulêre streke te identifiseer en kompartemente relevant is vir jou geen stel.
  

• Project Management: Bestuur jou ontledings deur die organisering van hulle in die projek dopgehou. Vinnig toegang vorige resultate met 'n paar muis klik of voeg nuwe soektogte bestaande projekte.
  

• Verskeie klein verbeterings en bugfixes

Vereistes :

• Mac OS X 10.2 of hoër
• Java 1.4.1 (update 1 word aanbeveel)
• verbinding met die internet
• 'n Genomatix evaluering rekening (gratis)