CWC Simulator

CWC Simulator is 'n C ++ implementering van CWC, 'n calculus vir die verteenwoordiging en simulasie van biologiese sisteme & nbsp;. Na 'n suksesvolle installasie (sien installeer) wat jy sal in staat wees om simulasies oor CWC modelle loop, soos getoon in 'n paar voorbeelde (sien voorbeelde /).
(Command-line) Interface
As 'n generiese gebruiker is, moet jy hardloop:

-i model.cwc
o
t
s
-n
-c
--qt-drumpel
-q
w
Waar:
- is die naam van die uitvoerbare (verstek: scwc);
& Nbsp; - model.cwc is die insette CWC program (sien voorbeelde);
& Nbsp; - die statistieke is die uitset-lêers voorvoegsel;
& Nbsp; - is die simulasie-tydsbeperking;
& Nbsp; - is die monsterneming tydperk (dws 0,12 tot 250 punte te kry met die tyd-perk = 30);
& Nbsp; - is die aantal gevalle van simulasie;
& Nbsp; - is die getal van clusters vir k-middel
& Nbsp; - is die drempel vir QT groepering
& Nbsp; - is die aantal Quantiles;
& Nbsp; - het gewoonlik die aantal kerne van jou stelsel te pas (dws 4 vir quad-core CPU).
Output
Die instrument produseer:
- Sommige .dat lêers (die gemonsterde uitset van die simulasies)
- Sommige Gnuplot skrifte statistiese analysises trek
Ons werk op 'n omvattende handleiding

Eienskappe :.

• Gillespie SSA algoritme oor CWC modelle
• Hybrid stogastiese / deterministiese semantiek
• Verskeie gevalle van simulasie met aanlyn statistieke
• Optimization vir multicore argitekture gebaseer op FastFlow raamwerk
• Extensible statistiese raamwerk (gemiddelde-variansie, gefiltreer groepering ens.)
• meerdere gradering semantiek (massa-aksie, Michaelis-Menten, Hill, ens.)