Die Spindel is 'n alternatiewe benadering vir biologiese identifikasie gebaseer op die lengte van ribosomale RNA (rRNA) gene streke. In die algemeen, roetes van primêre rRNA gensequenties van verskillende spesies toon afwisselend streke van nukleotied bewaring en variasie, beide in terme van nukleotied substitusies (algemeen bekend as "SNPs") en inplanting / skrap (indel) gebeure. Die teenwoordigheid van indels resultate in rye van verskillende lengtes en stel gapings in die belyning, tipies aangedui deur 'n tikkie "-".
Ons konsep vir biologiese identifikasie gebruik rRNA gensequenties soos volg: behoue streke word gebruik om veranderlike segmente ("Spindel hypervariable streke") in 'n kombinasie van die volgorde lengtes is kenmerkend van elke spesie ('n "Spindel profiel") te definieer. Dus, kan elke spesie word gedefinieer deur 'n unieke numeriese profiel.
In teorie, 'n opname van net 6 hypervariable gebiede met 20 allele elk (of 11 streke met 5 allele elk) is genoeg om al eukariotiese spesies op aarde, wat na raming tussen 5 en 15 miljoen in getal diskrimineer. In die praktyk, Spindel in staat is om 93,3% van eukariotiese spesies diskrimineer met 'n lae intraspesifieke variasie en hoë filogenetiese resolusie.
Kommentaar nie gevind