InterMine

InterMine bied toegang roetines data warehouses aangedryf deur InterMine tegnologie.
InterMine is 'n kragtige open source data pakhuis stelsel. Met behulp van InterMine, kan jy databasisse van biologiese data verkry deur gesofistikeerde web navraag gereedskap skep. Parsers word verskaf vir die integrasie van data uit verskeie algemene biologiese formate en daar is 'n raamwerk vir die toevoeging van jou eie data. InterMine sluit 'n aantreklike, gebruikers-vriendelike web koppelvlak wat werk 'uit die boks' en kan maklik aangepas word vir jou spesifieke behoeftes.
Alle InterMine kode is vrylik beskikbaar onder die LGPL lisensie

Wat is nuut in hierdie release:.

• skakel in te InterMine:
• Daar is verskeie nuwe maniere om te skakel in jou Myne. Sien Links vir meer besonderhede.
• Web diens into formate:
• Daar is verskeie nuwe webservice resultate formate. Neem deel aan jsonobjects wat in 0.95 verskyn, het ons nou into formaat vir pretty much alles anders:
• Resultate:
• jsonrows - tabel voorstelling van data met ekstra meta-data
• & quot; jsontable & quot; . - Houer-formaat vir die bou van ingeboude templates (sien: IMBedding handleiding)
• & quot; Telling & quot; en & quot; jsoncount & quot; - Formate vir net die ontvangs van die telling van 'n navraag
• WEBSERVICE meta-data (Model en Templates):
• & quot; into & quot; - Maklik parsable weergawes van die data model en beskikbaar sjabloon lys
• verifikasie werk nou in Perl WEBSERVICE Kliënt:
• Gebruikers van die Perl WEBSERVICE kliënt nou programmatiese toegang tot hul lyste en private templates. Eenvoudig gee jou login besonderhede aan die kliënt toegang tot jou rekening (jou besonderhede word oorgedra in geïnkripteer formaat). Hierdie funksie sal werk met al die myne webservices, nie net diegene by 0.96 en hoër.
• Object Resultate met WEBSERVICE Kliënte:
• Die Perl en Java kliënte in staat is om die resultate terug te kry as voorwerpe (into voorwerpe, of in die Perl, opgeblaas tot volle gevolg voorwerpe). Dit vereenvoudig sommige komplekse data verwerking probleme, en die hantering van die buitenste sluit en versamelings.
• Embedded Tabelle:
• Jy kan nou native insluit data tafels van enige myn met 'n ondersteunende webservice in jou webblaaie met JavaScript en CSS. Sien die IMBedding handleiding vir 'n demonstrasie en 'n inleiding tot hierdie tegniek. Maak seker om te speel met die nuwe JavaScript biblioteek beskikbaar by http://www.intermine.org/lib/imbedding.
• Register:
• Ons het begin met 'n sentrale registrasie diens vir InterMine implementering. Dit sal nie net dien as 'n & quot; Yellow-bladsye & quot ;, sodat besoekers nuwe data-bronne te ontdek, en die fasilitering van onderling tussen die myne self, maar dit ondersteun ook die webservices deur die verskaffing van 'n register van webservice urls en weergawes. Besoek die register http://www.intermine.org/registry, en vir hulp in jou eie myn registreer, besoek RegisteringYourMine.
• Link aansture:
• Jy kan 'n eiendom skakels in die resultate bladsye lei na enige URL te hê voeg. Sien LinkRedirects vir meer inligting.
• Tuisblad inhoud:
• Die tuisblad vir InterMine kan nou ingestel word om verskillende inligting wat gebaseer is op die vraag of die gebruiker is 'n nuwe te vertoon. Sien HomepageConfig vir instruksies oor hoe om hierdie gedrag te stel.
• New tag:

Im: admin
• Ons het 'n nuwe etiket bygevoeg. As jy 'n sjabloon met im tag: admin, sal dit nie wys in jou webapp. Dit is nuttig vir die wegsteek templates wat nodig is deur InterMine se webservices van jou gebruikers. Sien Tagging vir 'n lys van alle beskikbare tags.
• Lys oplaai:
• Die lys oplaai proses is verbeter.
• Ander veranderinge:
• UPDATE - meer streng verskeie hipotesetoetsing regstelling op verryking widgets. & Quot; aantal toetse & quot; is nou die aantal terme wat verband hou met die bronnelys.
• UPDATE - meer nuttig filter opsies op verryking widgets
• NEW - Holm-Bonferroni opsie bygevoeg om verryking widgets
• UPDATE - nuwe & quot; verwyder & quot; knoppie op lyste bladsy
• UPDATE - interaksies uitstaller gelaai via AJAX so rapporteer bladsy laai vinniger
• Fix - & quot; telling & quot; beelde korrek vertoon op die resultate
• UPDATE - QueryBuilder meer interaktiewe, kies 'n item in die lys sal jou neem na die oorspronklike item na bladsy refresh / herlaai
• UPDATE - skakel bygevoeg kolom opsomming in navraag resultate, maak dit makliker duidelike waardes te sien
• FIX - login fout met betrekking tot gemeng geval gebruikers
• Fix - widget fout wanneer jy na die uitvoer widget data
• NEW - sjabloon navrae bestel deur gewildheid, tensy jy aangeteken het, in welke geval hulle beveel deur die datum waarop elke navraag was die laaste lopie
• Fix - data is nie herhaal in die & quot; diverse & quot; afdeling oor verslag bladsye
• Fix - templates vertoon korrek op bladsy van die verslag, selfs vir subklasse
• Fix - templates korrek lewering op aspek bladsye
• UPDATE - opgedateer BioGRID converter veranderinge in nuutste data lêers te hanteer
• Fix - verskeie & quot; goud & quot; tema CSS en beelde verbeter en opgedateer
• Fix - draad veiligheid kwessie wat in sjabloon dop
• UPDATE - tafel widgets kan groep deur 'n kenmerk sowel as 'n klas

Vereistes :

• Python