Ascalaph Designer

Ascalaph Designer is 'n algemene doel program vir molekulêre dinamiese simulasies. Onder 'n enkele grafiese omgewing word voorgestel as hul eie implementering van molekulêre dinamika asook die metodes van klassieke en kwantum meganika van gewilde programme. Kenmerke sluit in molekulêre grafiese: verskeie vensters, twee kameras per model, CPK, Wire raam, Stick, Ball en Stick, en CPK draadraamwerk style, molekulêre model gebou: kristal bouer, ketting bouer, teken met 'n muis, molekulêre meetkunde redigering, voorlopige optimization , kwantum optimalisering, en botsings te verwyder, molekulêre meetkunde optimization met gradient metodes, molekulêre dinamika: verskeie keer stap integrasie, vierde orde integrasie, supercomputer berekeninge met behulp van MDynaMix, buigbare SPC water model, en implisiete water model, en kwantum chemie hulp van CP2K en PC GAMESS / Firefly. energie, molekulêre geometrie optimalisering, en potensiële afgelei aanklagte