MacMolPlt

MacMolPlt is 'n chemie visualisering hulpmiddel wat gebruik kan word om molekules te bou met 'n geïntegreerde grafiese model bouer, skep invoer lêers vir die GAMESS berekeningschemie program, en dan visualiseer die resultate van berekeningschemie lopies. Kenmerke sluit in 'n hoë-gehalte 3D-vertoning, animasie van normale modusse en reaksie rye en uitset na 'n verskeidenheid van formate, insluitend hoë-kwaliteit beelde en QuickTime en Flash films.

• Input behulp:
• MolPlt lêer formaat geslaan deur GAMESS
• deur plak in Cartesiese koördinate van enige GAMESS of Gauss log-lêer
• 'n GAMESS insette, teken of irc lêer
• Xmol styl XYZ lêer
• MolDen formaat lêers
• Proteïen Data Bank (PDB ) lêer
• Chemiese Markup Language (CML) lêers
• Bou grafies met 'n interaktiewe molekule redakteur
• Bou met die hand met behulp van Cartesiese of Z-oorsig styl interne koördinate
• 3D-vertoning van struktuur en normale modus
• Animasie van normale modusse.
• 3D real-time rotasie en translasie onder muis beheer
• berekening van enige Z-matriks parameter
• Visuele maatstaf / display afstande, hoeke en dihedrals.
• outomatiese skepping van Lineêre Minste Motion (LLM) paaie
• 2D en 3D berekening en die vertoning van:
• Molekulêre orbitale (AO se, MO's, of LMO se)
• Totaal elektrondigtheid
• Digtheid verskille
• Molekulêre elektrostatiese potensiale (MEPMaps)
• Basiese insette lêer generator vir GAMESS
• OpenGL gebruik vir hoë-gehalte 3D-vertoning
• Ondersteuning vir molekulêre simmetrie
• Genereer simmetrie afhanklik atome
• Bepaal simmetrie unieke atome
• bepaal outomaties die lys van ondersteun punt groepe vir 'n stel koördinate.
• Draai koördineer in die regte beginsel oriëntasie
• Display simmetrie operateurs vir baie punt groepe
• Publication gehalte uitset (kleur of swart en wit) via direkte druk of Kopieer en plak in 'n ander program.
• Uitgawe in 'n verskeidenheid van vorms, insluitend Windows bitmap, JPEG, PNG, CML, XMol XYZ, MDL molfile, POV-Ray, Flash Movies en QuickTime films.

Wat is nuut in hierdie release:

Verskeie verbeterings is aangebring aan die vertoning kode. Opsies is bygevoeg na die 3D Pane van die prefernces vir 'n gladde skadu met en sonder skaduwees.
Bygevoeg basiese ondersteuning vir Mopac lêers.
Bygevoeg opsie sigbaarheid van ab initio, MM, en EFP atome te skakel.
Verbeterde ondersteuning vir Model Core potensiale.
Bygevoeg 'n haak in die insette bouer vir die nuwe GAMESSQ program.
Verbeterde die PDB lêer parser.