miso (Mengsel van isoforme) is 'n kans raamwerk geskryf in Python dat quantitates die uitdrukking vlak & nbsp; van alternatiewelik gelas gene van RNA-Volg data, en identifiseer differensieel gereguleerde isoforme of eksons oor monsters.
Deur modellering van die generatiewe proses wat lui is afkomstig van isoforme in RNA-Volg die miso model gebruik Bayesiaanse inferensiemetodes die waarskynlikheid dat 'n lees ontstaan uit 'n bepaalde isoform te bereken.
Miso gebruik die afgeleide opdrag van lees te isoforme die verspreidings van die onderliggende stel alternatiewe mRNA isoforme te quantitate. Vertrouensintervalle oor ramings kan verkry word, wat die betroubaarheid van die skattings kwantifiseer.
Sien asseblief http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ vir miso handleiding en dokumentasie
Vereistes :.
- Python
Kommentaar nie gevind