Beste Bioinformatika Vir Linux
Genepidgin is 'n suite van Python gereedskap wat help evaluering en opdrag gene produk name & nbsp; Daar is drie primêre komponente.:genepidgin * skoner *& Nbsp; standaardiseer gene name per UNIPROT benaming riglynegenepidgin * vergelyk *& Nbsp;...
STAPPE is 'n pakket vir die presiese stogastiese simulasie van reaksie-diffusie stelsels in arbitrêr komplekse 3D geometrieë. Ons kern simulasie algoritme is 'n implementering van Gillespie se SSA, uitgebrei om te gaan met verspreiding van...
TRMiner is 'n Python nut wat daarop gemik is wetenskaplike data kurators & nbsp;. Dit laat vinnig snoei groot versamelings van wetenskaplike publikasies sinne wat relevant is vir 'n gegewe mynbou doel.Dit word bereik in twee stappe. Eerstens, is...
Die Bioinformatika Maatstaf System is 'n poging om 'n redelike toets raamwerk, toetse en data te bou, om eindgebruikers en verkopers in staat stel om die prestasie van hul stelsels te ondersoek.Wat ons probeer om te doen, is om 'n raamwerk vir...
Staden pakket is 'n ten volle ontwikkel stel DNA volgorde vergadering (Gap4), redigering en analise-instrumente (Spin) vir Unix, Linux, MacOSX en MS Windows.Op die Gap4 front is daar 'n paar klein by verwante geweesverbeterings in hoe dit tellings...
Arem is gebaseer op 'n MACS (Model Based Ontleding vir chip-SEQ data).Hoë deurset volgorde gekoppel aan chromatien immuno- neerslag (chip-SEQ) word algemeen gebruik in die karakterisering genoom-wye bindende patrone van transkripsie faktore,...
seriesoftubes is 'n uitgebreide pyplyn vir Solexa chip-ev data.Pakket Dokumentasie
Vereistes :
...
MetagenomeDB is 'n Python biblioteek ontwerp om maklik te slaan, kry en annoteer metagenomiese rye & nbsp;. MetagenomeDB optree as 'n abstraksie laag op die top van 'n MongoDB databasis. Dit bied 'n API om twee tipes voorwerpe, naamlik rye...
Seal is 'n Python module wat bied volgorde belyning op Hadoop.Seal is 'n van MapReduce aansoek vir biologiese volgorde belyning. Dit loop op Hadoop (http://hadoop.apache.org) deur Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), 'n Python MapReduce en...
miso (Mengsel van isoforme) is 'n kans raamwerk geskryf in Python dat quantitates die uitdrukking vlak & nbsp; van alternatiewelik gelas gene van RNA-Volg data, en identifiseer differensieel gereguleerde isoforme of eksons oor monsters.Deur...
